化膿性骨髓炎的并發(fā)癥包括全身性并發(fā)癥和局部并發(fā)癥。
一 、全身并發(fā)癥
（一）貧血、低蛋白血癥 慢性化膿性骨髓炎病程遷延，長期反復(fù)急性發(fā)作，低熱和竇道內(nèi)膿性分泌物的排出，對全身將產(chǎn)生慢性消耗性損害。貧血和低蛋白血癥是慢性化膿性骨髓炎的常見并發(fā)癥。這些并發(fā)癥的存在，進不步降低了全身及局部的抗病能力。對慢性化膿性骨髓炎的治療更增添了不利因素，從而形成惡性循環(huán)。因此，在慢性化膿性骨髓炎的治療中糾正貧血及治療低蛋白癥甚為重要。
（二）全身性淀粉樣變 淀粉樣變是病理學(xué)上組織變性的一種，分全身性與局限性兩種。全身性淀粉樣變并發(fā)于象慢性化膿性骨髓炎這樣的長期反復(fù)化膿性炎癥。病理學(xué)表現(xiàn)為全身臟器的細胞間隙、血管基底膜上淀粉樣物質(zhì)的沉積。沉積物實際上是一種蛋白類物質(zhì)，但具有遇碘變藍的性質(zhì)。病變的臟器常發(fā)生嚴重的功能損害。幸運的是，該病在我國罕見。
二 、局部并發(fā)癥
（一）病理骨折 當(dāng)骨的破壞嚴重且廣泛，而骨包殼尚未形成，或者骨包殼不牢固時，在外力作用下，即便是比較輕微的外力，也可造成骨折——即病理骨折。因此，在此期間患肢應(yīng)予以制動，用石膏固定或牽引治療，以預(yù)防病理骨折的發(fā)生。待骨包殼完全形成且牢固以后，可拆除固定。
（二）骨不連 病理骨折發(fā)生后未進行及時正確的治療，可發(fā)生骨不連。另外，在骨包殼尚未完全形成之前進行手術(shù)治療，摘除大塊死骨，亦可造成骨缺損或骨不連。由于局部血循環(huán)差，病骨的破壞仍在繼續(xù)進行，這種骨折愈合十分困難，日久將形成假關(guān)節(jié)，使整個治療更加復(fù)雜和困難。假關(guān)節(jié)分兩種，一種為接觸型，另一種為大塊骨缺損型，后者治療更為困難。
（三）化膿性關(guān)節(jié)炎 干骺端化膿性骨髓炎，膿腫可通過兩個途徑進入關(guān)節(jié)腔合并化膿性關(guān)節(jié)炎。一是通過骺板血管交通支，膿腫穿破關(guān)節(jié)軟骨直接進入關(guān)節(jié)，形成化膿性關(guān)節(jié)炎。這種情況多見于嬰幼兒及成人化膿性骨髓炎。另一種情況是干骺端位于關(guān)節(jié)囊內(nèi)時（如股骨頸位于髖關(guān)節(jié)囊內(nèi)），則膿腫可穿破干骺斷骨皮質(zhì)而進入關(guān)節(jié)。關(guān)節(jié)內(nèi)膿液破壞關(guān)節(jié)軟骨，侵犯軟骨下骨質(zhì)，嚴重影響關(guān)節(jié)功能，甚至完全強直。
（四）脊髓或馬尾神經(jīng)受壓 化膿性脊椎炎尤其是椎弓、椎板破壞后，膿腫、壞死組織及新生的纖維組織可壓迫脊髓或馬尾神經(jīng)引起截癱或神經(jīng)根受壓。這種情況多見于頸段及胸段脊椎。感染亦可波及蛛網(wǎng)膜引起蛛網(wǎng)膜炎。
（五）惡性變 化膿性骨髓炎發(fā)生惡變多見于病程長者。常見于病程在10年以上的中老年男性患者。