兩型錐蟲病的病情嚴(yán)重程度及發(fā)展過程均有所不同。如岡比亞型感染后多無癥狀，可持續(xù)數(shù)月甚至幾年，此階段約半數(shù)有頸淋巴結(jié)病。初期多無“下疳”。淋巴血液期癥狀輕。腦膜腦炎出現(xiàn)較晚，進(jìn)展緩慢。羅得西亞型潛伏期為2～3周。發(fā)病急，病情重，多有急性中毒癥狀，如發(fā)熱高，消瘦明顯，迅速衰竭，并有繼發(fā)感染或心肌炎等。但淋巴結(jié)病較輕。自然過程常于6～9個(gè)月以內(nèi)死于毒血癥。腦膜腦炎可發(fā)生在早期，且進(jìn)展迅速，但也有典型的睡眠病癥狀,尚未出現(xiàn)即死亡者。錐蟲病按病程分三期：
1.初期 被感染性采采蠅叮咬2～3天后，局部皮膚紅腫，伴疼痛及壓痛，質(zhì)地較硬，即錐蟲性“下疳”，其直徑約3～10cm，形成潰瘍者罕見。經(jīng)常有局部淋巴結(jié)腫大。“下疳”經(jīng)2～4周后自行消散。擠壓“下疳”，在擠出的水腫液中，有時(shí)可查見錐蟲。只是在此階段就醫(yī)者甚少。
2.淋巴血液期(錐蟲血癥期，Ⅰ期) 潛伏期一般為10天至3周，個(gè)別病例可長(zhǎng)達(dá)5年。錐蟲經(jīng)淋巴系統(tǒng)進(jìn)入血液循環(huán)時(shí)，可出現(xiàn)不規(guī)則或間歇型高熱，伴隨劇烈的進(jìn)行性頭痛、乏力、皮膚瘙癢、肌痛和關(guān)節(jié)痛;以及進(jìn)行性淋巴結(jié)腫大，可為局限性或全身性。岡比亞型多見于頸部，特別是頸后三角區(qū)，稱Winterbottom征，羅得西亞型以鎖骨上、腋窩與腹股溝等處為多，其部位不同可能與不同采采蠅叮咬習(xí)慣不同有關(guān)。腫大淋巴結(jié)直徑為1～2cm，柔軟無壓痛，能活動(dòng)，一般為多發(fā)。
發(fā)熱期持續(xù)1周或更長(zhǎng)時(shí)間后即間歇，隨著錐蟲抗原變異，產(chǎn)生免疫逃避而使發(fā)熱定期再起。此期蟲血癥明顯。發(fā)熱可以很輕，特別是岡比亞型。暫時(shí)性皮疹可見于膚色淺的患者，多見于胸背及上腹部。一般在發(fā)病后6～8周出現(xiàn)，呈卵圓、環(huán)形，淡紅色，數(shù)日后消退。隨著疾病的進(jìn)展，發(fā)熱漸少，至晚期則極罕見。在此期間可出現(xiàn)不同器官的損傷，如致命性的心肌炎，以羅得西亞型為突出。脾臟中等度腫大者約占25%～50%，肝可腫大并有血清AST與ALT升高。患者易發(fā)生繼發(fā)性支氣管肺炎。也可有虹膜睫狀體炎、視神經(jīng)萎縮、周期性腹瀉，大便可有黏液和血。還可有貧血、外周水腫、腹水、心包積液及肺水腫。另外男性可有陽痿，育齡婦女可閉經(jīng)或流產(chǎn)。
3.腦膜腦炎期(睡眠期，晚期，Ⅱ期) 以中樞神經(jīng)系統(tǒng)癥狀為主者，即屬于晚期。此時(shí)患者體重明顯下降，不久即不能負(fù)擔(dān)正常工作，頭痛變?yōu)槌掷m(xù)性，反應(yīng)遲鈍，出現(xiàn)嗜睡，并進(jìn)行性惡化，例外的是夜間失眠。臨床上引起腦膜腦炎。羅得西亞型見于病后2～6周，進(jìn)展迅速。岡比亞型見于病后數(shù)月至數(shù)年。錐蟲首先侵犯腦干與間腦，繼而皮質(zhì)。癥狀為性格改變，對(duì)周圍事物漠不關(guān)心，面無表情，行動(dòng)遲鈍，言語吞吐，遲鈍的感覺過敏(輕捏患者深部肌肉，需稍過一會(huì)兒才感疼痛，疼痛程度較正常重，即kerandel征)，唇舌顫動(dòng)，肌肉震顫，步態(tài)不穩(wěn)，并有妄想、狂躁、明顯精神病表現(xiàn)，以及癲癇樣抽搐等。舞蹈病樣動(dòng)作與共濟(jì)失調(diào)多見于兒童，隨病情進(jìn)展出現(xiàn)肌強(qiáng)直、嗜睡，繼之昏睡，昏迷，并伴有全身瘙癢。此階段腦脊液檢查可見白細(xì)胞計(jì)數(shù)增加，通常>100×106/L，末期多死于高度營(yíng)養(yǎng)不良、肺部繼發(fā)感染、癲癇持續(xù)狀態(tài)或心力衰竭等。
凡從非洲流行區(qū)來的人發(fā)現(xiàn)錐蟲性“下疳”、不規(guī)則發(fā)熱、劇烈頭痛、嗜睡、昏睡、淋巴結(jié)腫大、心動(dòng)過速者均有助于診斷。確診有賴于病原體的發(fā)現(xiàn)。

錐蟲性“下疳”應(yīng)與其他昆蟲叮咬、蜂窩織炎或焦癡作鑒別。淋巴血液期應(yīng)與瘧疾、傷寒、回歸熱、病毒性出血熱等發(fā)熱疾病相鑒別。晚期應(yīng)與腦性瘧疾、病毒性腦炎、細(xì)菌性腦膜炎的急性期、結(jié)核性腦膜炎、神經(jīng)梅毒和腦脊液中以單核細(xì)胞增加為主的各種腦膜炎或腦膜腦炎相鑒別。應(yīng)注意本病偶有梅毒血清試驗(yàn)陽性者。