一、縱隔腫瘤，心絞痛，食管神經(jīng)官能癥及食管癌，賁門癌等：
縱隔腫瘤在鑒別診斷上并無困難，心絞痛多由勞累誘發(fā)，而本病則為吞咽所誘發(fā)，并有咽下困難，此點(diǎn)可資鑒別，食管神經(jīng)官能癥(如癔球癥)大多表現(xiàn)為咽至食管部位有異物阻塞感，但進(jìn)食并無梗噎癥狀，食管良性狹窄和由胃，膽囊病變所致的反射性食管痙攣，食管僅有輕度擴(kuò)張，本病與食管癌，賁門癌的鑒別診斷最為重要，癌性食管狹窄的X線特征為局部粘膜破壞和紊亂;狹窄處呈中度擴(kuò)張，而本病則常致極度擴(kuò)張，食管賁門癌造成的狹窄是由于癌組織浸潤(rùn)管壁所致，黏膜有破壞，可形成潰瘍，腫塊等改變，病變多以管壁的一側(cè)為主，狹窄被動(dòng)擴(kuò)張性差，內(nèi)鏡通過阻力較大，狹窄嚴(yán)重者，常無法通過，強(qiáng)力插鏡易造成穿孔。
賁門失弛緩癥的X 線診斷一般并不困難，典型的X 線表現(xiàn)為食管下端呈鳥嘴狀狹窄，但賁門癌特別是縮窄型型癌亦可使食管下端呈鳥嘴狀狹窄，鋇劑通過困難，與賁門失弛緩癥難以鑒別，值得注意的是，賁門失弛緩癥可以并發(fā)食管癌或賁門癌，發(fā)生率為315 % ，原因可能為食管黏膜長(zhǎng)期受到潴留物刺激，發(fā)生潰瘍，黏膜上皮增生惡變等，故對(duì)于高齡，病程較短，癥狀不典型的病例，診斷賁門失弛緩癥需慎重，對(duì)于已確診多年的賁門失弛緩癥患者也應(yīng)警惕癌變的可能。
二、原發(fā)性與繼發(fā)性的賁門失弛緩癥
賁門失弛緩癥有原發(fā)和繼發(fā)之分，后者也稱為假性賁門失弛緩癥(p seudoachalasia) ，指由胃癌，食管癌，肺癌，肝癌，江胰腺癌，淋巴瘤等惡性腫瘤，南美錐蟲病，淀粉樣變，結(jié)節(jié)病，神經(jīng)纖維瘤病，嗜酸細(xì)胞性胃腸炎，慢性特發(fā)性假性腸梗阻等所引起的類似原發(fā)性賁門失弛緩癥的食管運(yùn)動(dòng)異常，假性失弛緩癥 病人有吞咽困難癥狀，X線檢查食管體部有擴(kuò)張，遠(yuǎn)端括約肌不能松弛，測(cè)壓和X線檢查均無蠕動(dòng)波，這種情況發(fā)生在食管接合部的黏膜下層及腸肌叢有浸潤(rùn)性病變存在的疾病，最常見的原因是胃癌浸潤(rùn)，其他少見疾病如淋巴瘤及淀粉樣變，肝癌亦可發(fā)現(xiàn)相似的征象，內(nèi)鏡檢查中未經(jīng)預(yù)先擴(kuò)張，該段不能將器械通過，因?yàn)榻?rùn)病變部位僵硬，大多數(shù)情況下活檢可確診，有時(shí)須探查才能肯定診斷。
三、無蠕動(dòng)性異常
硬皮癥可造成食管遠(yuǎn)端一段無蠕動(dòng)，并造成診斷困難，因食管受累常先于皮膚表現(xiàn)，食管測(cè)壓發(fā)現(xiàn)食管近端常無受累，而食管體部蠕動(dòng)波極少，遠(yuǎn)端括約肌常呈無力，但松弛正常，無蠕動(dòng)性功能異常亦可在伴有的周圍性神經(jīng)疾病中見到，如發(fā)生于糖尿病及多發(fā)性硬化癥的病人。
四、迷走神經(jīng)切斷后的吞咽困難
經(jīng)胸或腹途徑切斷迷走神經(jīng)后能發(fā)生吞咽困難，經(jīng)高選擇性迷走神經(jīng)切斷術(shù)后約75%的病人可發(fā)生暫時(shí)性吞咽困難，大多數(shù)情況下術(shù)后6周癥狀可以逐漸消失，X線及測(cè)壓檢查中，可見到食管遠(yuǎn)端括約肌不能松弛及偶然無蠕動(dòng)，但很少需要擴(kuò)張及外科治療，根據(jù)病史可以鑒別。
四、老年食管
老年人中食管運(yùn)動(dòng)功能紊亂是由于器官的退行性變?cè)谑彻苌系谋憩F(xiàn)，大多數(shù)老年人在測(cè)壓檢查中發(fā)現(xiàn)食管運(yùn)動(dòng)功能不良，原發(fā)性及繼發(fā)性蠕動(dòng)均有障礙，吞咽后或自發(fā)的經(jīng)常發(fā)生無蠕動(dòng)性收縮，食管下端括約肌松弛的次數(shù)減少或不出現(xiàn)，但食管內(nèi)靜止壓不增加。
五、Chagas病
可以有巨食管，為南美局部流行的錐蟲寄生的疾病，并同時(shí)累及全身器官，其臨床表現(xiàn)與失弛緩癥不易區(qū)別，由于繼發(fā)于寄生蟲感染使腸肌叢退化，在生理學(xué)，藥物學(xué)及治療反應(yīng)上與原發(fā)性失弛緩癥相似，Chagas病除食管病變外，尚有其他內(nèi)臟的改變，診斷前必須確定病人曾在南美或南非居住過，用熒光免疫及補(bǔ)體結(jié)合試驗(yàn)可確定錐蟲病的過去感染史。