本病有靜止期和活動期之分。靜止期的病人沒有什么癥狀。而活動期的病人則有以下一些表現：
(1)發(fā)熱。病人多為低熱，當有嚴重的并發(fā)癥時(如腸穿孔所引起的腹膜炎)才有高熱。
(2)腹痛。呈持續(xù)性隱痛或陣發(fā)性劇痛，疼痛的部位依病變的部位不同而異，最常見的是右下腹痛，容易被誤診為闌尾炎。
(3)腹瀉?；颊呙刻旄篂a三五次，糞便較稀，也有像拉痢疾一樣的里急后重，但是卻見不到拉痢疾時所常見的粘液或膿血。
(4)體重下降。由于這種病是一種慢性病，所以病人因為長期腹瀉、發(fā)熱，身體消耗多，腸道的吸收卻不好，所以會出現體重下降。
(5)貧血。這是繼發(fā)營養(yǎng)不良的結果。另外，不論是活動期，還是靜止期，在病人的腹部都可能摸到包塊。
克羅恩病可以發(fā)生許多并發(fā)癥，如腸梗阻、消化道出血、腹膜炎、腸瘺，并且還可能發(fā)生癌變?；加锌肆_恩病的患者容易發(fā)生結腸癌，發(fā)病率是正常人的20倍。
鏡下觀：病變復雜多樣，裂隙狀潰瘍表面被覆壞死組織，其下腸壁各層可見大量淋巴細胞、巨噬細胞與漿細胞浸潤稱為穿壁性炎癥，可見淋巴組織增生并有淋巴濾泡形成，約半數以上病例出現結核樣肉芽腫，但無干酪樣壞死改變。腸粘膜下層增厚、水腫，其中有多數擴張的淋巴管。
影像學表現
1、“跳躍區(qū)征”：病變區(qū)呈不連續(xù)的節(jié)段性跳躍分布特征，鋇劑排空迅速，在病變段腸管反復出現激惹征象。
2、“卵石征”：早期粘膜皺襞增粗、變平消失。病變發(fā)展，粘膜下層大量肉芽組織增生產生卵石狀充盈缺損，稱“卵石征”。
3.粘膜皺襞出現縱形龕影：在平行的縱形龕影裂隙之間可見多數橫行狀如蜈蚣狀小裂隙。
4、“線樣征”：回腸段腸管大量纖維化，腸腔呈邊緣不規(guī)則的線樣狹窄，稱“線樣征”，為慢性狹窄期的典型表現。狹窄區(qū)范圍不同，狹窄區(qū)以上腸管擴張，可伴完全或不完全梗阻。
需與潰瘍型腸結核及急性壞死性腸炎鑒別。