(一)治療
抗真菌素有多種，但國內外以制霉菌素應用最廣，其有抑菌和殺菌的作用，它與真菌細胞膜的類固醇結合，改變膜的通透性，致成鉀、鈉、鎂漏出，導致菌體縮小和細胞膜內氨基酸丟失以致死亡。制霉菌素腸道吸收很少，不會引起菌群失調。還有氟胞嘧啶(5-氟胞嘧啶)和咪唑衍生物如克霉唑也可治療念珠菌感染。前者脫氨后滲入RNA，破壞菌體蛋白質合成，腸道吸收，副作用小。后者使真菌細胞質溶解，抑制其生長。常規(guī)治療，一般持續(xù)10天，若癥狀未完全消失尚可延長，通常治療后癥狀可迅速改善，X線及內鏡下改變1周左右即可完全恢復，不留后遺癥。如有全身性真菌感染，可選用兩性霉素B靜注，其副作用大，小心慎用，注意毒性反應。在治療上尚應積極設法消除誘因，特別是合理應用抗生素和皮質激素。
(二)預后
1.正規(guī)抗真菌治療常可取得良好效果，但對抗生素治療原發(fā)感染的同時繼發(fā)之真菌感染，臨床頗難處理，治療效果也常不佳。故應合理地應用抗生素和類固醇激素治療。
2.因真菌感染所致的食管嚴重狹窄，外科處理時需慎重考慮。