㈠全身支持療效：對施行大手術(shù)患者，手術(shù)前注意補(bǔ)充營養(yǎng)，亦可肌注丙種球蛋白以提高機(jī)體免疫機(jī)能。有研究表明，潰結(jié)患者肌注入免疫球蛋白可使結(jié)腸內(nèi)乳酸桿菌和雙岐桿菌增加，某些條件致病菌減少。也可試用注射轉(zhuǎn)移因子，免疫核糖核酸、胸腺素等，亦可用白細(xì)胞介素2，每次5萬U肌注，10日為一療程，可連續(xù)應(yīng)用。
㈡原因治療：如由于巨結(jié)腸，膽囊炎引起的腸球菌過度繁殖；維生素缺乏造成的腸球菌減少或消失；小腸蠕動過快而引起的酵母菌過多等，都必須無除去這些原因，然后再扶持正常菌群，方能奏效。
㈢調(diào)整菌群治療：
1、飲食調(diào)整：發(fā)酵性腹瀉應(yīng)限制碳水化合物；腐敗性腹瀉應(yīng)限制蛋白質(zhì)的攝入。增強(qiáng)腸粘膜的局部防御屏障功能，防止細(xì)菌易位，應(yīng)增加纖維食物。
2、抗菌藥物：立即停止原抗生素，應(yīng)根據(jù)菌群分析以及抗菌藥物敏感試驗，選用合適的抗生素以及抑制過度繁殖的細(xì)菌，從而間接扶植腸道繁殖不足的細(xì)菌。此外還可采用廣譜抗菌藥物將腸道細(xì)菌大部分消滅，然后再灌入正常腸道菌群的菌液以使其恢復(fù)。
3、活菌制劑：目前常用的活菌制劑有嗜酸乳桿菌、保加利亞乳桿菌、乳酸乳桿菌、芽胞乳桿菌、分叉乳桿菌、糞鏈球菌、大腸桿菌、糞桿菌和枯草桿菌等。其中以分叉乳桿菌制劑療效最好?？莶輻U菌制劑療效也較好，其療效機(jī)制可能是由于該菌是需氧的，能吸收氧氧，降低腸腔氧化還原電位，支持厭氧菌（類桿菌、乳桿菌）生長，從而間接扶植了正常菌菌群。還可以用正常人大便懸液做成復(fù)方活菌制劑用來治療葡萄球菌引起的偽膜性腸炎，收到較好的效果。用乳酸鏈球菌制成的乳酶生，臨床廣泛應(yīng)用效果亦好。適用腸道正常菌群中繁殖不足的耐藥株做成制劑，以利定值，亦是調(diào)整腸道菌群失調(diào)的有效方法。目前最新的生物制品麗珠腸樂（回春生膠囊）為雙岐桿菌活菌制劑(bifidobiogne)，據(jù)藥一研究表明該制劑具有屏障作用、控制內(nèi)霉素血癥作用、營養(yǎng)作用、抗腫瘤作用、免疫增強(qiáng)作用、抗衰老作用等。
4、菌群促進(jìn)劑：口服菌群促進(jìn)劑，亦可達(dá)到扶植正常菌群的目的。如用乳醣扶植在腸桿菌，用葉酸扶植腸球菌，兒童常用分叉桿菌因子促進(jìn)分叉乳桿菌生長。應(yīng)用半乳糖甙一果酸，受細(xì)菌分解后形成乳酸或醋酸，使pH值降低，抑制其他細(xì)菌，而支持乳桿菌生長。
5、耐藥性腸球菌制劑：日本目黑氏等采用增厚傳代培養(yÇŽng)法獲得了耐鏈霉素、紅霉素、四環(huán)節(jié)、氨芐青霉素的腸球菌一類鏈球菌BIO—4Ræ ª。經(jÄ«ng)動物和人體內(nèi)試驗表明，本菌具有耐多種抗菌素性，故能阻止其他菌群異常繁殖，克服菌群失調(diào)，改善大便性異常，且比以往單用抗菌素治療療效迅捷，并能防止糞鏈球菌BIO—4R株的耐藥因子向大腸桿菌K—12株轉(zhuÇŽn)移。
6、中醫(yÄ«)中藥：中醫(yÄ«)認(rèn)為：“泄瀉之本，無不由于脾胃”。急性泄瀉病多偏實，責(zé)在脾胃；慢性泄瀉病多為虛，每及脾腎。前者當(dāng)清熱化濕，后者應(yÄ«ng)高補(bÇ”)脾腎。中藥中的清熱解毒藥對體液免疫有影響，如蒲公英、白花蛇舌草等能促進(jìn)抗體生成，魚腥草能提高備解素濃度，而備解素、C3、Mg++組成的備解系統(tÇ’ng)對痢疾桿菌、沙門氏菌、綠膿桿菌等革蘭氏陰性桿菌有一定殺滅作用，是機(jÄ«)體產(chÇŽn)生抗體前的一種重要的非特異性的免疫防御功能。在應(yÄ«ng)用中醫(yÄ«)辯證論治治療腸道菌群失調(diào)時，均應(yÄ«ng)考慮以上藥物的作用，于清熱化濕、補(bÇ”)氣健脾、和胃滲濕、溫腎健脾等法中，適當(dāng)配伍應(yÄ«ng)用則效果比較理想。