口腔念珠菌病以局部治療為主，但嚴(yán)重病例及慢性念珠菌感染常需輔以全身治療才能奏效。
1.局部藥物治療
（1）2%～4%碳酸氫鈉（小蘇打）溶液：本藥系治療嬰幼兒鵝口瘡的常用藥物。用于哺乳前后洗滌口腔，以消除能分解產(chǎn)酸的殘留凝乳或糖類，使口腔成為堿性環(huán)境，可阻止白色念珠菌的生長和繁殖。輕癥患兒不用其它藥物，病變在2～3天內(nèi)即可消失，但仍需繼續(xù)用藥數(shù)日，以預(yù)防復(fù)發(fā)。也可用本藥在哺乳前后洗凈乳頭，以免交叉感染或重復(fù)感染。
（2）龍膽紫水溶液：龍膽紫液在1∶10萬的濃度時，仍能抑制念珠菌的生長?？谇徽衬ひ杂?/2000（0.05%）濃度為宜，每日涂搽3次，以治療嬰幼兒鵝口瘡和口角炎。但藥物染色后，不宜觀察損害的變化。市售1%龍膽紫醇溶液，因刺激性大，不宜直接用于嬰幼兒口腔粘膜，但可用于皮膚病損。
（3）洗必泰：洗必泰有抗真菌作用，可選用0.2%溶液或1%凝膠局部涂布，沖洗或含漱，也可與制霉菌素配伍成軟膏或霜劑，其中亦可加入適量去炎舒松，以治療口角炎、托牙性口炎等（可將霜劑涂于基托組織面戴入口中）。以洗必泰液與碳酸氫鈉液交替漱洗，可消除白色念珠菌的協(xié)同致病菌——革蘭氏陰性菌。
2.抗真菌藥物治療
（1）制霉菌素（mycostatin）：本藥屬四烯類抗生素，1mg相當(dāng)于2000U，宜于低溫存放。不易被腸道吸收，故多用于治療皮膚、粘膜以及消化道的白色念珠菌感染。局部可用5萬～10萬U/ml的水混懸液涂布，每2～3小時一次，涂布后可咽下。也可用含漱劑漱口，或制成含片、乳劑等。兒童（1～2歲）口服10萬U/次，每日3次；成人口服50萬～100萬U/次，每日3次。本藥的抑菌作用，可能是通過破壞細(xì)胞膜釋放鉀，從而引起細(xì)胞內(nèi)糖原分解中止而失去活力。口服副作用極小，偶爾有引起惡心、腹瀉或食欲減退者。療程7～10日。
（2）咪康唑（miconazole）:本藥為人工合成的廣譜抗真菌藥，局部使用的硝酸咪康唑的國內(nèi)商品名達克寧。除抗真菌外，本藥尚具有抗革蘭氏陽性細(xì)菌的作用。散劑可用于口腔粘膜，霜劑適用于舌炎及口角炎，療程一般為10日。
（3）克霉唑（clotrimazole）：為合成廣譜抗真菌劑，毒性較大，口服后吸收迅速，4～5小時血液中達到最高濃度，并可進入粘膜和唾液中。本藥能影響麥角固醇的合成，從而使真菌細(xì)胞膜缺損，內(nèi)容物溢出而導(dǎo)致真菌死亡。成人每日口服3次，每次0.5g，日劑量最多3g。本藥的副作用主要為腸道反應(yīng)；長期使用可影響肝功能，引起白細(xì)胞減少，故目前多使用局部制劑。
（4）酮康唑（ketoconazole）：為國外70年代后推薦使用的抗白色念珠菌新藥，能抑制真菌細(xì)胞膜DNA和RNA，療效快，口服吸收2小時后達到峰值，通過血循環(huán)達到病變區(qū)。劑量為每日一次口服200mg，2～4周一療程。并可與其它局部用的抗真菌藥合用，效果更好。對于皮膚、消化道等口腔外真菌病也有明顯療效，目前在國外已代替二性霉素。本藥不可與制酸藥或抗膽堿藥同服，以免影響吸收。
3.綜合性治療
對粘膜明顯充血水腫、舌質(zhì)紅、口臭、尿黃、便秘等心火上炎或胃熱夾濕見證者，可服用“口炎沖劑”。
除用抗真菌藥物外，對身體衰弱，有免疫缺陷病或與之有關(guān)的全身疾病及慢性念珠菌感染的患者，常需輔以增強機體免疫力的綜合治療措施，如注射轉(zhuǎn)移因子、胸腺素、脂多糖等，補充鐵劑、維生素A；以及多次少量輸血等。
口腔白色念珠菌病的治療時間應(yīng)適當(dāng)延長，一般以14日為期，過早停藥易致病損復(fù)發(fā)。而肥厚型（增殖型）的療程應(yīng)更長，有報道可達3～4個月，療效不顯著的白色念珠菌性白斑，應(yīng)及早考慮手術(shù)切除。