1.潛伏期 一般為10～15天，最短2天，長者可達(dá)35天。
2.前驅(qū)期 一般數(shù)小時至3天，部分患者和重型患者前驅(qū)期不明顯。前驅(qū)期主要表現(xiàn)為低熱、頭昏、乏力、全身不適、四肢酸痛。大多數(shù)患者為急性發(fā)病，呈急性型經(jīng)過。
3.急性期病程 一般為2～3周。
(1)發(fā)熱：一般起病2～3天發(fā)熱達(dá)高峰(39.5～4l℃)，大多數(shù)患者持續(xù)5～10天，然后階梯狀下降，經(jīng)2～3天下降至正常。熱型多為弛張熱，部分患者可出現(xiàn)稽留熱或不規(guī)則熱。
(2)全身中毒癥狀：高熱時伴頭痛、全身肌肉痛、無力、食欲缺乏、惡心、嘔吐等，并由于血管運動中樞的損害，患者還可出現(xiàn)面部、頸部潮紅，結(jié)膜充血，脈搏緩慢。部分重癥患者有心肌炎表現(xiàn)，常有心音低鈍，心率增快，心電圖檢查有T波改變。嚴(yán)重患者可以突然出現(xiàn)心功能不全，急性肺水腫等。
(3)意識障礙和精神損害：約半數(shù)以上患者有不同程度神志、意識變化，如昏睡、表情淡漠、意識模糊、昏迷，亦可出現(xiàn)譫妄和精神錯亂。
(4)腦膜受累的表現(xiàn)：最常見的癥狀是劇烈頭痛，以顳部及后枕部持續(xù)鈍痛多見，有時為爆炸性和搏動性，呈撕裂樣全頭痛，伴惡心、嘔吐、頸項強直，腦膜刺激征。一般持續(xù)5～10天，可和昏迷同時存在，當(dāng)意識清醒后，還可持續(xù)存在1周左右。
(5)肌肉癱瘓：以頸肌及肩胛肌與上肢聯(lián)合癱瘓最多見，下肢肌肉和顏面肌癱瘓較少，癱瘓多呈弛緩型，此與乙型腦炎不同。一般出現(xiàn)在病程第2～5天，大多數(shù)患者經(jīng)2～3周后逐漸恢復(fù)，少數(shù)留有后遺癥而出現(xiàn)肌肉萎縮，成為殘廢。由于頸肌和肩胛肌癱瘓而出現(xiàn)本病特有頭部下垂表現(xiàn)，肩胛肌癱瘓時，手臂搖擺無依狀態(tài)。
(6)神經(jīng)系統(tǒng)損害的其他表現(xiàn)：部分患者出現(xiàn)錐體外系統(tǒng)受損征，如震顫、不自主運動等。偶爾可見語言障礙、吞咽困難等延髓麻痹癥狀，或中樞性面神經(jīng)和舌下神經(jīng)的輕癱。
4.恢復(fù)期 此期持續(xù)平均10～14天，體溫下降，肢體癱瘓逐步恢復(fù)，神志轉(zhuǎn)清，各種癥狀消失。
森林腦炎一般病程14～28天，但有少數(shù)患者可留有后遺癥，如失語、癡呆、吞咽困難、不自主運動，還有少數(shù)病情遷延可達(dá)數(shù)月或1～2年之久，患者表現(xiàn)為弛緩性癱瘓、癲癇及精神障礙。
近年來國內(nèi)報告，急性期患者的臨床癥狀較過去有所減輕，病死率也明顯降低，可能與采取免疫注射，加強對癥治療有關(guān)。
5.臨床分型 按病情輕重分為下列4型。
(1)重型：突發(fā)高熱、頭痛、昏迷、迅速出現(xiàn)腦膜刺激征及頸肌和肢體肌肉癱瘓，或在發(fā)病短期出現(xiàn)上行性麻痹。危重患者如搶救不及時，可于1～2天內(nèi)死亡，少數(shù)5～10天內(nèi)或遷延數(shù)月因呼吸衰竭等而死亡。
(2)普通型(中型)：出現(xiàn)高熱、頭痛、嘔吐及腦膜刺激征，伴有不同程度肌肉癱瘓，多在7～10天體溫降至正常。
(3)輕型：多有發(fā)熱、頭痛、頭昏、食欲缺乏和全身酸痛等全身感染癥狀及腦膜刺激征，腦癥狀不明顯。多在5～7天體溫開始下降，逐步降至正常，無后遺癥。
(4)頓挫型：僅有輕度頭痛，可有惡心、嘔吐,體溫38℃左右，維持l～3天即迅速下降。
6.按臨床神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)與病理特點的分型
(1)腦膜炎型：主要是頭痛、惡心、嘔吐及頸項強直等腦膜受累的臨床表現(xiàn)，而無癱瘓或意識障礙。
(2)腦膜腦炎型：除腦膜炎型癥狀外尚可出現(xiàn)不同程度的意識障礙，可伴有驚厥、錐體束征或錐體外系統(tǒng)體征。
(3)腦干型：除腦膜腦炎癥狀，還有腦干運動神經(jīng)核損害表現(xiàn)。如面神經(jīng)和舌下神經(jīng)癱瘓，語言障礙和吞咽困難等表現(xiàn)。
(4)脊髓灰質(zhì)炎型：主要表現(xiàn)為肌肉弛緩性癱瘓。
(5)上升型(Landry型)：開始癥狀輕，下肢出現(xiàn)癱瘓，此后病變隨神經(jīng)通路上升至頸部，可致周圍性呼吸麻痹，最后為延髓麻痹。
(6)混合型：是臨床上癥狀最重的一型，具有上述幾型臨床綜合表現(xiàn)，病死率極高。
診斷依據(jù)流行季節(jié)(春秋季5～7月)在疫區(qū)曾有蜱叮咬病史，或飲生奶史。臨床表現(xiàn)有高熱、頭痛、惡心、嘔吐、頸肌癱瘓;白細(xì)胞升高，腦脊液壓力增高，細(xì)胞數(shù)及蛋白質(zhì)輕度增加;血清學(xué)檢測補體結(jié)合、血凝抑制、ELISA試驗陽性，或RT-PCR檢查陽性。

需與結(jié)核性腦膜炎、化膿性腦膜炎、流行性乙型腦炎、流行性腮腺炎、脊髓灰質(zhì)炎、柯薩奇及?？刹《镜人轮袠猩窠?jīng)系統(tǒng)感染等鑒別。
1.流行性乙型腦炎 流行季節(jié)為夏秋季，發(fā)病年齡主要是10歲以下兒童，發(fā)病地區(qū)主要在溫帶及亞熱帶，臨床表現(xiàn)急性期以肌張力升高、強直性痙攣多見，一般不出現(xiàn)弛緩型癱瘓和肌肉萎縮。
2.脊髓灰質(zhì)炎 多見于幼兒，一般是肢體弛緩性癱瘓，而頸肌、肩胛肌癱瘓使頭下垂者少見，鮮有意識障礙。
3.感染性多發(fā)性神經(jīng)炎 亦可出現(xiàn)肌肉弛緩性癱瘓，但一般呈對稱性，且常伴有感覺障礙。